伊吾县位于**维吾尔自治区东北部，天山北麓东段，东北部与蒙古国交界，西部与巴里坤哈萨克自治县相邻，南部与哈密市隔山相望，喀尔里克山主峰最高达4886米，淖毛湖盆地最低海拔为260米，县城海拔为1700米。